W ramach Chełmskiego Centrum Ewangelizacji funkcjonuje Szkoła Ewangelizacji, której zadaniem jest organizowanie ewangelizacyjnych kursów, a więc rekolekcji, które wyróżniają się nowym zapałem oraz nowymi metodami i środkami wyrazu.

ChCE działa we współpracy z Pallotyńską Szkołą Nowej Ewangelizacji oraz wchodzi w ramy Szkoły Ewangelizacji Św. Andrzeja (SESA). Jest to ogół szkół ewangelizacji na świecie, które mają wspólną wizję, metodologię i program formacyjny. SESA została założona przez Jose H. Prado Floresa z Meksyku i rozprzestrzeniła się na ponad 70 krajów.

Kursy SNE posiadają potrójny wymiar (KeKaKo):

I. KErygmatyczny: chrystocentryczny i biblijny
II. KArisma: w mocy Ducha Świętego
III. KOinonia: wymiar wspólnotowy

Misją Szkoły jest formować nowych ewangelizatorów, a więc prawdziwych świadków wiary, które swoje życie oparli na Chrystusie, dla nowej ewangelizacji, czyli do posługi, do tego, aby iść na cały świat i głosić Ewangelię wszelkiemu stworzeniu (por. Mk 16,15).

Kursy Szkoły Nowej Ewangelizacji podzielone są na trzy etapy, z których każdy zawiera siedem tematycznych kursów formacyjnych.

I ETAP: Podstawy życia chrześcijańskiego

1. Nowe życie: Podstawowa Ewangelizacja.
2. Emaus: Słowo Boże.
3. Jan: Formacja uczniów.
4. Jezus w czterech Ewangeliach.
5. Historia Zbawienia: Nasza własna historia.
6. Mojżesz: Formacja wyzwolicieli.
7. Błogosławieństwa: Droga do szczęścia.

II ETAP: Jak ewangelizować

1. Paweł: Formacja ewangelizatorów.
2. Tymoteusz: Jak czytać, podkreślać i zapamiętywać Biblię.
3. Apollos: Formacja głoszących.
4. Sekret Pawła.
5. Pięćdziesiątnica: Ewangelizować z wielką mocą.
6. Wprowadzenie do Biblii.
7. Łukasz: Apologetyka.

III ETAP: Jak formować ewangelizatorów

1. Maria: List Chrystusa.
2. Teologia biblijna.
3. Maranatha: Apokalipsa.
4. Piotr: Eklezjologia.
5. Melchizedek: Liturgia.
6. Nehemiasz: Doktryna społeczna Kościoła.
7. Jetro: Ekumenizm.